packmol 构建分子动力学初始结构 060630

packmol 构建分子动力学初始结构球状 管状 层状 .packmol是一个构建分子动力学模拟初始模型的软件。060630依据设定的条件,在空间范围内填充分子,形成不同的体系,如球状、管状、层状等体系。能够保证短程相互作用斥力不会影响模拟。很多朋友不会安装这个软件!windows下已经编译好了,所以可以直接用,就是下载后不需要进行其他操作的意思…不过为了可以在任意文件路径下使用packmol.exe,最好将packmol添加到环境变量里面。
运行方法:
准备一个xxx.inp的文件进行测试运行,可以从官网的example例子里面找;
进windows cmd执行packmol < xxx.inp使用;
备注:【xxx.inp】是个举例说明的文件的例子…
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已收录的具体版本如下:
packmol 20.3.3 EN 英文版含安装参考视频

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