Cresset-BMD Flare是用于基于配体和结构的药物设计的绝佳解决方案060695，让药物研究、开发设计人士能够仔细地检查配体，深入了解其蛋白质靶标和配体，放心地进行先导化合物优化。现在用户不需要花费大量的时间就能获得优化的结果，更具信心地制定决策，准确地计算和简单地操作，便捷地沟通，Flare V9在最新解决方案中带来Spark生物等排体替换、同源建模、集成 MM/GBSA 等一系列新增和改进，为所有用户带来了新的和增强的科学功能和方法。
新功能
1、简化分子发现，从新想法的产生到Flare内的广泛优化
Spark中的Bioisostere替换在静电和形状产品空间中工作，以更好地描述分子的生物活性，从而能够创建新的IP用户友好的向导驱动访问各种实验。访问优秀的Bioisotere源以生成新的项目想法通过Flare Python API创建自定义工作流和自动化任务来提高效率
2、基于配体和结构的药物设计火炬
通过高分辨率3D可视化和对靶结构和潜在配体的深入分析，Flare使用户能够高效有效地优化和优先考虑新分子。
3、使用各种各样的实验为您的项目产生高度创新的想法
为核心组和终末组寻找与生物学相关的替代品
将配体放入空口袋
从真实的化学中识别连接体，以连接两个配体
4、 MM/GBSA动力学
分子力学/广义玻恩表面积（MM/GBSA）是一种计算配体-蛋白质结合自由能的方法。通过在MD轨迹过程中平均MM/GBSA结合自由能来估计一组配体的结合自由能，以获得更准确的结果。
5、 同源性建模
同源建模是一种在靶蛋白的3D结构尚不清楚且只有其一级序列可用时构建靶蛋白3D模型的方法。该方法依赖于在Flare中构建精确模型的两个要求：与靶标具有相似序列和功能的蛋白质的3D实验确定结构，以及氨基酸的靶标序列。
6、 Flare V9中的其他新功能和增强功能可以自信地推进优化：
更高度可定制的选项，用于微调动力学模拟
自定义执行Flare FEP计算每个步骤的条件，以及更直观的条件
故障排除工具
无缝管理Python扩展，以访问高级数据可视化和计算
通过增强的扩展管理器实现功能
使用JupyterLab Notebook集成编写、保存和运行自己的脚本
功能特色
1、基于配体的药物设计软件组件
基于配体的药物设计者利用 Flare 根据分子的形状、静电和结合活性对其分子进行仔细检查、比较和确定优先级。通过预测新化合物的活性和 ADMET 特性的强大 QSAR 模型，用户可以在整个潜在客户组合中建立信心和理解。
2、基于结构的药物设计软件组件
借助多种方法，包括对接和评分、静电互补性™、分子动力学、口袋分析和水分析（GIST 和 3D-RISM），基于结构的药物设计人员可以获得对蛋白质-配体结合的新见解。基于围绕配体和蛋白质静电的既定专有方法，结合我们自己的内部和开源研究，用户能够充分了解其目标结构的特征和相互作用。
3、Flare 中的 Spark
通过无缝访问 Flare 的 Cresset 生物等排体替代解决方案 Spark™，进一步简化您的分子设计工作流程并提高您的生产力。
4、Flare 扩展和集成
借助 Python API，Flare 功能是完全可自定义和可扩展的。无论是通过开发自己的扩展，还是希望包含 Cresset 的预制扩展之一，Flare 的 Python 集成都提供了对各种新功能和专用菜单的访问。Flare 还与 DMTA 协作工具 Torx 无缝连接，以简化整个 DMTA 周期的协作。
本页收录的具体版本如下：
Cresset-BMD Flare v9.0.0
